El Fmoc-L-Proline se utiliza en la síntesis de péptidos para introducir prolina, un aminoácido conocido por inducir giros en las cadenas peptídicas y afectar la conformación general de péptidos y proteínas. El grupo protector Fmoc permite la adición secuencial de aminoácidos, y la prolina desempeña un papel fundamental en las relaciones estructura-actividad de los péptidos bioactivos, incluidos los péptidos de señalización, los inhibidores de enzimas y los péptidos antimicrobianos.