Se utiliza en la detección de iones de nitrito en muestras de orina. El molibdato de estroncio tiene una emisión de energía baja, que se puede detectar mediante espectrometría de fluorescencia. Este compuesto también se utiliza como catalizador para la producción de óxido nítrico y en la producción de etilendiamina (utilizada en la fabricación de nailon). El molibdato de estroncio se puede utilizar como parte de una celda de muestra para determinar el tamaño de partícula.